Jak podają Teresa Palacz i Dorota Matyaszczyk w książce "Katalog cmentarzy żydowskich w Wielkopolsce", cmentarz gminy żydowskiej w Środzie Wielkopolskiej powstał zapewne w XVIII lub XIX wieku. Nekropolię założono w pobliżu drogi do Nekli, w sąsiedztwie cmentarza katolickiego. Obiekt został zniszczony podczas drugiej wojny światowej - usunięto wówczas nagrobki, a na jego terenie urządzono żwirowisko. Po wojnie część działki cmentarnej wykorzystano do pochówków ludności katolickiej, drugą część - jako pole uprawne.
Dziś o obecności Żydów w mieście przypomina przebudowany i zaadaptowany na bibliotekę gmach dawnej synagogi, na którym wisi niewielka tabliczka z napisem następującej treści: "W tym miejscu w latach 1874-1939 znajdowała się synagoga wyznania mojżeszowego".